研究Protein,这些技术不得不看
2017-8-11 来源:不详 浏览次数:次RNA最近几年可火了,RNA小鲜肉F4:miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA,它们直接或者间接调节mRNA的翻译、基因转录,这些科研热点也成为做实验发paper的最爱,不管核心还是SCI,不管是CNS还是低分SCI,不管是灌水还是酝酿大招,不带个非编码RNA(noncodingRNA)研究机制在里面都不好意思投稿,不拉上miRNA感觉故事讲不下去,可以编码蛋白、正经干活的mRNA被冷落,大家纷纷开始喜欢遍布细胞各处的监工:非编码RNA(ncRNA)
诚然ncRNA确实成为近些年颜值较高、能来事儿、人见人爱的十大杰青之一,但归根结底还要和表型联系在一起,最终还是要通过蛋白质去实现表观遗传的本领,所以发大文章、走上巅峰,除了抱ncRNA的大腿外,蛋白质的分析功夫可不能丢,这不,X湿兄这几天就在温故而知新:蛋白质的常规检测技术。
那么,我们对蛋白质的哪些特点感兴趣呢?
(一)蛋白质的分子量、有无亚基?
(二)蛋白质的序列
(三)蛋白质的功能预测
(四)胞内蛋白质在哪里工作?胞外蛋白呢?
(五)蛋白质的磷酸化检测
(六)蛋白质-蛋白质相互作用
(七)蛋白质和DNA、RNA相互作用
(一)蛋白质的分子量、有无亚基
技术:蛋白层析、SDS-PAGE、Native-PAGE
当你发现一个未曾被报道过的蛋白质,想要知道它的分子量大小、有无亚基时,你可以做以下实验,如血红蛋白就是四聚体。
1)天然蛋白的分离:蛋白层析法(这种情况较少)
也称分子筛层析,这是根据分子大小分离蛋白质混合物最有效的方法之一。柱中最常用的填充材料是葡萄糖凝胶(Sephadexged),下面这个品牌PharmaciaTM大家可以自行搜索一下,在蛋白层析界,那就是一拳超人般的存在,市场份额最大(小张说这是广告,要删了,但真不是广告啊)。
2)重组蛋白的分离:6*HIS标签、GST蛋白标签等
想当年X湿兄做了多少次重组蛋白的纯化啊,一把辛酸泪呢!
大家都钓过鱼吧,重组蛋白就是利用这种原理
1.池塘:大肠杆菌或哺乳动物细胞被诱导表达后混合物,目的蛋白(targetprotein)就在其中。
2.鱼饵:能特异性吸附蛋白质头部或尾部的蛋白标签(例如HIS组氨酸标签被镍离子吸附)
3.鱼竿:层析柱里面的凝胶填料,固相载体。